细胞基因编缉服务
分类: 细胞基因编缉
发布时间: 2015-04-26 16:25
细胞株基因敲除或敲入。基因敲除细胞系广泛应用于基因功能、信号传导、代谢机理、药效评价等研究。由于细胞系靶向基因敲除具有操作简单,周期短,易操控,稳定遗传等特点,历来受到研究者的青睐。TALEN和CRISPR/Cas9的相继问世,将靶向基因操纵推向一个又一个高潮。作为国内最早提供这两项技术服务的公司之一,已为各科研院校医院提供数百例哺乳动物、鱼、家禽细胞系靶向基因编缉服务。
服务内容
步骤 |
技术方案 |
配套产品 |
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选择技术 |
TALEN |
CRISPR/Cas9 |
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细胞评估(预实验) |
评估细胞种类,转染难度,基因拷贝数等(内容附后) |
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设计靶点 |
一般设计3-5个,从中选2-3个有切割活性且活性高的靶点 |
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靶点活性验证 |
—— |
体外酶切法验证靶点活性(可选) |
Cas9/gRNA靶点效率检测试剂盒;CAS9酶 |
载体构建 |
选择适合载体(附后),使用纳米自组装技术(PCT专利)组装增强型E-TALEN |
选择适合载体(附后),构建gRNA/Cas9载体 |
E-TALEN载体构建试剂盒 gRNA/Cas9载体构建试剂盒 |
SSA活性检测 |
E-TALEN质粒和靶点共转293T细胞,检测luciferase活性(可选) |
—— |
SSA报道质粒构建试剂盒 |
细胞内源活性验证 |
将打靶载体转入目标细胞,检测切割效率 |
核酸免提试剂盒 T7E1酶 |
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筛选细胞株 |
铺3个以上96well板,细胞长满后,打散提DNA,T7E1酶检测突变株 |
核酸免提试剂盒 T7E1酶 |
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确认有意突变 |
扩增靶序列,测序确认有义突变体 |
核酸免提试剂盒 |
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蛋白质验证 |
western blot |
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注:对于难转染的细胞可考虑使用CRISPR-Cas9慢病毒载体系统
预试验内容
1、细胞的转染效率:尝试各种转染方法,如Lipo2000、LTX、电转等,以期找到转染效率相对高的方式。
2、药筛浓度检测:如果转染效率不高,而过流式对细胞损伤很大,需要做抗性筛选,检测出杀死细胞的筛选药物的最小浓度。
3、单克隆培养情况:观察细胞是否可以单克隆培养,起码需要两周时间培养才能检测单克隆培养周期。这个周期很大程度影响了细胞的检测周期。
4、细胞中目标基因存在多个拷贝,这样的敲除将大大增加了工作的难度。
风险提示
一、敲除的不确定性
1、设计多个靶点都没有内源活性,可能是切割区域内存在染色质复杂结构,建议换一个新的区域。(参考文献NAR,2014年)。
2、筛选一轮需要检测100-200个单克隆细胞,约一个月时间。要拿到纯合子一般需要多轮筛选
二、致死基因的敲除风险
1、致死:如细胞周期调控基因、House keeping基因等,敲除后有可能导致细胞死亡或者状态不佳。因此无法获得纯合子的细胞株。
2、关键基因:这些基因的敲除有可能导致细胞的生长状态不佳。
3、其他:少数基因获得纯合子后,在增殖过程中,生长状态会变的越来越差,最终导致无法运输。
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